על מנת שמערכת גביית מס ערך מוסף תתפקד כראוי, קבע המחוקק שורה של כללים לניהול חשבונות והוצאת חשבוניות המהווים בסיס לתשלום המס וניכויו.
אי ביצוע הוראות ניהול פנקסים, דיווח לא נכון, דיווח שאינו במועד, ואי תשלום המס במועד, פוגעים בתפקודה של מערכת המס. המחוקק הבחין בין עבירות מע"מ טכניות, אשר אין מאחוריהן כל כוונה פלילית, לבין עבירות מהותיות, שמטרתן התחמקות ממשית מתשלום מס.